El Parque de los Deseos ha recibido el aval del máximo órgano de ciencia y tecnología del país, Colciencias. En comunicación recibida el día 28 de julio de 2003, la Secretaría General del Instituto Colombiano para el Desarrollo de la Ciencia y la Tecnología "Francisco José de Caldas" Colciencias, certifica que el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología en su sesión del día 9 de julio, acta N. AcCNCyT-02/2003 calificó como de carácter CIENTÍFICO - APROPIACIÓN PÚBLICA DE LA CIENCIA Y LA TECNOLOGÍA , el Parque de los Deseos.

Somos el primer parque tecnológico en Colombia que recibe esta certificación, este respaldo nos permite mostrarle al mundo que la Fundación EE.PP.M E.S.P. a través del Parque de los Deseos desarrolla ciencia y tecnología y la pone al alcance de toda la comunidad. Además, los centros de investigación de las universidades que intervinieron en el proyecto ( Universidad de Antioquia, la Universidad Pontificia Bolivariana y EAFIT) , también se benefician de este reconocimiento traduciéndose para ellos en un mejor posicionamiento ante Colciencias.